Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36,45■■■■□ 3,43
Fndc1E9Q043 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36,45■■■■□ 3,43
Fndc1E9Q043 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,45■■■■□ 3,43
Fndc1E9Q043 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Fndc1E9Q043 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
Fndc1E9Q043 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36,44■■■■□ 3,42
Fndc1E9Q043 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,43■■■■□ 3,42
Fndc1E9Q043 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36,42■■■■□ 3,42
Fndc1E9Q043 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC36,41■■■■□ 3,42
Fndc1E9Q043 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Fndc1E9Q043 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Fndc1E9Q043 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36,39■■■■□ 3,42
Fndc1E9Q043 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Fndc1E9Q043 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,37■■■■□ 3,41
Fndc1E9Q043 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Fndc1E9Q043 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Fndc1E9Q043 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Fndc1E9Q043 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Fndc1E9Q043 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36,34■■■■□ 3,41
Fndc1E9Q043 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Fndc1E9Q043 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Fndc1E9Q043 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Fndc1E9Q043 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Fndc1E9Q043 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36,31■■■■□ 3,4
Fndc1E9Q043 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36,3■■■■□ 3,4
Fndc1E9Q043 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Fndc1E9Q043 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36,28■■■■□ 3,4
Fndc1E9Q043 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36,28■■■■□ 3,4
Fndc1E9Q043 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Fndc1E9Q043 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Fndc1E9Q043 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Fndc1E9Q043 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,27■■■■□ 3,4
Fndc1E9Q043 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Fndc1E9Q043 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Fndc1E9Q043 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Fndc1E9Q043 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,25■■■■□ 3,39
Fndc1E9Q043 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Fndc1E9Q043 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36,23■■■■□ 3,39
Fndc1E9Q043 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Fndc1E9Q043 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Fndc1E9Q043 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36,22■■■■□ 3,39
Fndc1E9Q043 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Fndc1E9Q043 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36,22■■■■□ 3,39
Fndc1E9Q043 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Fndc1E9Q043 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Fndc1E9Q043 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36,2■■■■□ 3,38
Fndc1E9Q043 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC36,19■■■■□ 3,38
Fndc1E9Q043 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Fndc1E9Q043 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Fndc1E9Q043 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Fndc1E9Q043 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Fndc1E9Q043 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Fndc1E9Q043 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Fndc1E9Q043 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Fndc1E9Q043 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Fndc1E9Q043 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Fndc1E9Q043 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36,14■■■■□ 3,38
Fndc1E9Q043 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Fndc1E9Q043 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36,12■■■■□ 3,37
Fndc1E9Q043 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Fndc1E9Q043 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Fndc1E9Q043 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Fndc1E9Q043 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Fndc1E9Q043 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36,09■■■■□ 3,37
Fndc1E9Q043 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Fndc1E9Q043 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Fndc1E9Q043 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Fndc1E9Q043 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Fndc1E9Q043 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,03■■■■□ 3,36
Fndc1E9Q043 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,02■■■■□ 3,36
Fndc1E9Q043 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC36,01■■■■□ 3,36
Fndc1E9Q043 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,99■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC35,98■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC35,98■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC35,97■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC35,96■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC35,95■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Fndc1E9Q043 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Fndc1E9Q043 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Fndc1E9Q043 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Fndc1E9Q043 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Fndc1E9Q043 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Fndc1E9Q043 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC35,93■■■■□ 3,34
Fndc1E9Q043 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Fndc1E9Q043 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Fndc1E9Q043 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC35,92■■■■□ 3,34
Fndc1E9Q043 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Fndc1E9Q043 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,91■■■■□ 3,34
Fndc1E9Q043 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,3 ms