Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gm20425E9Q035 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gm20425E9Q035 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm20425E9Q035 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm20425E9Q035 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm20425E9Q035 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gm20425E9Q035 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm20425E9Q035 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm20425E9Q035 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm20425E9Q035 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm20425E9Q035 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm20425E9Q035 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm20425E9Q035 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm20425E9Q035 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm20425E9Q035 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm20425E9Q035 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gm20425E9Q035 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gm20425E9Q035 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm20425E9Q035 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm20425E9Q035 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm20425E9Q035 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm20425E9Q035 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm20425E9Q035 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm20425E9Q035 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm20425E9Q035 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm20425E9Q035 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Gm20425E9Q035 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm20425E9Q035 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gm20425E9Q035 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm20425E9Q035 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm20425E9Q035 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm20425E9Q035 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm20425E9Q035 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm20425E9Q035 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm20425E9Q035 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm20425E9Q035 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm20425E9Q035 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm20425E9Q035 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm20425E9Q035 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gm20425E9Q035 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm20425E9Q035 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm20425E9Q035 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm20425E9Q035 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm20425E9Q035 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm20425E9Q035 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm20425E9Q035 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm20425E9Q035 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm20425E9Q035 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm20425E9Q035 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm20425E9Q035 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm20425E9Q035 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm20425E9Q035 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm20425E9Q035 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm20425E9Q035 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm20425E9Q035 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.4 ms