Protein–RNA interactions for Protein: E9PWQ3

Col6a3, Collagen, type VI, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 3,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a3E9PWQ3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col6a3E9PWQ3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Col6a3E9PWQ3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col6a3E9PWQ3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Col6a3E9PWQ3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col6a3E9PWQ3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Col6a3E9PWQ3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col6a3E9PWQ3 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Col6a3E9PWQ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col6a3E9PWQ3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Col6a3E9PWQ3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col6a3E9PWQ3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Col6a3E9PWQ3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col6a3E9PWQ3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col6a3E9PWQ3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Col6a3E9PWQ3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col6a3E9PWQ3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Col6a3E9PWQ3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col6a3E9PWQ3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Col6a3E9PWQ3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Col6a3E9PWQ3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Col6a3E9PWQ3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col6a3E9PWQ3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Col6a3E9PWQ3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col6a3E9PWQ3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Col6a3E9PWQ3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Col6a3E9PWQ3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Col6a3E9PWQ3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col6a3E9PWQ3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col6a3E9PWQ3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Col6a3E9PWQ3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Col6a3E9PWQ3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Col6a3E9PWQ3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Col6a3E9PWQ3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Col6a3E9PWQ3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col6a3E9PWQ3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Col6a3E9PWQ3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Col6a3E9PWQ3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col6a3E9PWQ3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col6a3E9PWQ3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Col6a3E9PWQ3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col6a3E9PWQ3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col6a3E9PWQ3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Col6a3E9PWQ3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col6a3E9PWQ3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms