Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms