Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf1D3YY23 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf1D3YY23 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf1D3YY23 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lonrf1D3YY23 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lonrf1D3YY23 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lonrf1D3YY23 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lonrf1D3YY23 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lonrf1D3YY23 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lonrf1D3YY23 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lonrf1D3YY23 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lonrf1D3YY23 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lonrf1D3YY23 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lonrf1D3YY23 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lonrf1D3YY23 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lonrf1D3YY23 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonrf1D3YY23 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonrf1D3YY23 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonrf1D3YY23 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lonrf1D3YY23 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lonrf1D3YY23 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lonrf1D3YY23 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lonrf1D3YY23 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lonrf1D3YY23 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lonrf1D3YY23 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lonrf1D3YY23 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lonrf1D3YY23 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lonrf1D3YY23 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lonrf1D3YY23 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms