Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Samd1D3YXK1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Samd1D3YXK1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samd1D3YXK1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Samd1D3YXK1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Samd1D3YXK1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms