Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30cD3YVI9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim30cD3YVI9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30cD3YVI9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30cD3YVI9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim30cD3YVI9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30cD3YVI9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30cD3YVI9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30cD3YVI9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim30cD3YVI9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim30cD3YVI9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim30cD3YVI9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim30cD3YVI9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim30cD3YVI9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim30cD3YVI9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim30cD3YVI9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim30cD3YVI9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim30cD3YVI9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim30cD3YVI9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim30cD3YVI9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim30cD3YVI9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim30cD3YVI9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim30cD3YVI9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim30cD3YVI9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim30cD3YVI9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim30cD3YVI9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim30cD3YVI9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim30cD3YVI9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim30cD3YVI9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim30cD3YVI9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim30cD3YVI9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim30cD3YVI9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim30cD3YVI9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim30cD3YVI9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim30cD3YVI9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim30cD3YVI9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim30cD3YVI9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms