Protein–RNA interactions for Protein: D0VYS2

Hsf3, Heat shock factor protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf3D0VYS2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hsf3D0VYS2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hsf3D0VYS2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hsf3D0VYS2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hsf3D0VYS2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hsf3D0VYS2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hsf3D0VYS2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hsf3D0VYS2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hsf3D0VYS2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hsf3D0VYS2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hsf3D0VYS2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hsf3D0VYS2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hsf3D0VYS2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hsf3D0VYS2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hsf3D0VYS2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hsf3D0VYS2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hsf3D0VYS2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hsf3D0VYS2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hsf3D0VYS2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hsf3D0VYS2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hsf3D0VYS2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hsf3D0VYS2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms