Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ppfia4B8QI36 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ppfia4B8QI36 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ppfia4B8QI36 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfia4B8QI36 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfia4B8QI36 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ppfia4B8QI36 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia4B8QI36 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ppfia4B8QI36 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia4B8QI36 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia4B8QI36 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia4B8QI36 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia4B8QI36 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ppfia4B8QI36 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ppfia4B8QI36 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppfia4B8QI36 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppfia4B8QI36 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppfia4B8QI36 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms