Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Siah3B2RWG3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Siah3B2RWG3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Siah3B2RWG3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Siah3B2RWG3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Siah3B2RWG3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Siah3B2RWG3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Siah3B2RWG3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Siah3B2RWG3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Siah3B2RWG3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Siah3B2RWG3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Siah3B2RWG3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Siah3B2RWG3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Siah3B2RWG3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Siah3B2RWG3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Siah3B2RWG3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Siah3B2RWG3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Siah3B2RWG3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Siah3B2RWG3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Siah3B2RWG3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Siah3B2RWG3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Siah3B2RWG3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah3B2RWG3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah3B2RWG3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah3B2RWG3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah3B2RWG3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Siah3B2RWG3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah3B2RWG3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Siah3B2RWG3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah3B2RWG3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Siah3B2RWG3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Siah3B2RWG3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Siah3B2RWG3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Siah3B2RWG3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Siah3B2RWG3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Siah3B2RWG3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Siah3B2RWG3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Siah3B2RWG3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Siah3B2RWG3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Siah3B2RWG3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Siah3B2RWG3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Siah3B2RWG3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Siah3B2RWG3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Siah3B2RWG3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Siah3B2RWG3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms