Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Apba1B2RUJ5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Apba1B2RUJ5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Apba1B2RUJ5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apba1B2RUJ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Apba1B2RUJ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Apba1B2RUJ5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apba1B2RUJ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apba1B2RUJ5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Apba1B2RUJ5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Apba1B2RUJ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Apba1B2RUJ5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Apba1B2RUJ5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apba1B2RUJ5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Apba1B2RUJ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Apba1B2RUJ5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apba1B2RUJ5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Apba1B2RUJ5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms