Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn34b1B1AZQ8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cldn34b1B1AZQ8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn34b1B1AZQ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn34b1B1AZQ8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn34b1B1AZQ8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn34b1B1AZQ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn34b1B1AZQ8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn34b1B1AZQ8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn34b1B1AZQ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cldn34b1B1AZQ8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn34b1B1AZQ8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn34b1B1AZQ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn34b1B1AZQ8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn34b1B1AZQ8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn34b1B1AZQ8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn34b1B1AZQ8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn34b1B1AZQ8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn34b1B1AZQ8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn34b1B1AZQ8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn34b1B1AZQ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn34b1B1AZQ8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn34b1B1AZQ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn34b1B1AZQ8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn34b1B1AZQ8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn34b1B1AZQ8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn34b1B1AZQ8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cldn34b1B1AZQ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn34b1B1AZQ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn34b1B1AZQ8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn34b1B1AZQ8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn34b1B1AZQ8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn34b1B1AZQ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn34b1B1AZQ8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn34b1B1AZQ8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn34b1B1AZQ8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn34b1B1AZQ8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn34b1B1AZQ8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn34b1B1AZQ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn34b1B1AZQ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn34b1B1AZQ8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cldn34b1B1AZQ8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn34b1B1AZQ8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn34b1B1AZQ8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn34b1B1AZQ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn34b1B1AZQ8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn34b1B1AZQ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cldn34b1B1AZQ8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cldn34b1B1AZQ8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn34b1B1AZQ8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn34b1B1AZQ8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cldn34b1B1AZQ8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn34b1B1AZQ8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn34b1B1AZQ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cldn34b1B1AZQ8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cldn34b1B1AZQ8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn34b1B1AZQ8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn34b1B1AZQ8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cldn34b1B1AZQ8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cldn34b1B1AZQ8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
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