Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CK137956B1AYM9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CK137956B1AYM9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CK137956B1AYM9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CK137956B1AYM9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CK137956B1AYM9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CK137956B1AYM9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CK137956B1AYM9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CK137956B1AYM9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CK137956B1AYM9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CK137956B1AYM9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CK137956B1AYM9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CK137956B1AYM9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CK137956B1AYM9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CK137956B1AYM9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CK137956B1AYM9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CK137956B1AYM9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CK137956B1AYM9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CK137956B1AYM9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CK137956B1AYM9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CK137956B1AYM9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CK137956B1AYM9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CK137956B1AYM9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CK137956B1AYM9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CK137956B1AYM9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CK137956B1AYM9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CK137956B1AYM9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CK137956B1AYM9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CK137956B1AYM9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CK137956B1AYM9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CK137956B1AYM9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CK137956B1AYM9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CK137956B1AYM9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CK137956B1AYM9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CK137956B1AYM9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CK137956B1AYM9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CK137956B1AYM9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CK137956B1AYM9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CK137956B1AYM9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CK137956B1AYM9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CK137956B1AYM9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CK137956B1AYM9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CK137956B1AYM9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CK137956B1AYM9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CK137956B1AYM9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CK137956B1AYM9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CK137956B1AYM9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CK137956B1AYM9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CK137956B1AYM9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CK137956B1AYM9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CK137956B1AYM9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CK137956B1AYM9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CK137956B1AYM9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CK137956B1AYM9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CK137956B1AYM9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CK137956B1AYM9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CK137956B1AYM9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms