Protein–RNA interactions for Protein: A6PWV5

Arid3c, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3cA6PWV5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Arid3cA6PWV5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Arid3cA6PWV5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
Arid3cA6PWV5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Arid3cA6PWV5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Arid3cA6PWV5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Arid3cA6PWV5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Arid3cA6PWV5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Arid3cA6PWV5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
Arid3cA6PWV5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Arid3cA6PWV5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Arid3cA6PWV5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Arid3cA6PWV5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Arid3cA6PWV5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Arid3cA6PWV5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Arid3cA6PWV5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Arid3cA6PWV5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
Arid3cA6PWV5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Arid3cA6PWV5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Arid3cA6PWV5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Arid3cA6PWV5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Arid3cA6PWV5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Arid3cA6PWV5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Arid3cA6PWV5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Arid3cA6PWV5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Arid3cA6PWV5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
Arid3cA6PWV5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Arid3cA6PWV5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Arid3cA6PWV5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Arid3cA6PWV5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Arid3cA6PWV5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Arid3cA6PWV5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Arid3cA6PWV5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Arid3cA6PWV5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Arid3cA6PWV5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Arid3cA6PWV5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Arid3cA6PWV5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Arid3cA6PWV5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Arid3cA6PWV5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Arid3cA6PWV5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
Arid3cA6PWV5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Arid3cA6PWV5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Arid3cA6PWV5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Arid3cA6PWV5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Arid3cA6PWV5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Arid3cA6PWV5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Arid3cA6PWV5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Arid3cA6PWV5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Arid3cA6PWV5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Arid3cA6PWV5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
Arid3cA6PWV5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Arid3cA6PWV5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Arid3cA6PWV5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Arid3cA6PWV5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Arid3cA6PWV5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Arid3cA6PWV5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Arid3cA6PWV5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Arid3cA6PWV5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Arid3cA6PWV5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Arid3cA6PWV5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Arid3cA6PWV5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Arid3cA6PWV5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Arid3cA6PWV5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Arid3cA6PWV5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Arid3cA6PWV5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Arid3cA6PWV5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Arid3cA6PWV5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Arid3cA6PWV5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Arid3cA6PWV5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
Arid3cA6PWV5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Arid3cA6PWV5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Arid3cA6PWV5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Arid3cA6PWV5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Arid3cA6PWV5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Arid3cA6PWV5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Arid3cA6PWV5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Arid3cA6PWV5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Arid3cA6PWV5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Arid3cA6PWV5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Arid3cA6PWV5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Arid3cA6PWV5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Arid3cA6PWV5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Arid3cA6PWV5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Arid3cA6PWV5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Arid3cA6PWV5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Arid3cA6PWV5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Arid3cA6PWV5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Arid3cA6PWV5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Arid3cA6PWV5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Arid3cA6PWV5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Arid3cA6PWV5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Arid3cA6PWV5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Arid3cA6PWV5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Arid3cA6PWV5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Arid3cA6PWV5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Arid3cA6PWV5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Arid3cA6PWV5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Arid3cA6PWV5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Arid3cA6PWV5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Arid3cA6PWV5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms