Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trgv2A2J008 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trgv2A2J008 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trgv2A2J008 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trgv2A2J008 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trgv2A2J008 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trgv2A2J008 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Trgv2A2J008 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trgv2A2J008 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trgv2A2J008 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trgv2A2J008 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trgv2A2J008 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trgv2A2J008 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trgv2A2J008 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trgv2A2J008 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trgv2A2J008 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trgv2A2J008 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trgv2A2J008 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trgv2A2J008 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trgv2A2J008 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trgv2A2J008 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trgv2A2J008 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trgv2A2J008 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trgv2A2J008 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trgv2A2J008 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trgv2A2J008 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trgv2A2J008 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trgv2A2J008 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trgv2A2J008 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trgv2A2J008 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trgv2A2J008 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trgv2A2J008 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trgv2A2J008 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trgv2A2J008 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trgv2A2J008 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trgv2A2J008 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trgv2A2J008 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trgv2A2J008 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trgv2A2J008 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trgv2A2J008 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trgv2A2J008 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trgv2A2J008 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trgv2A2J008 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trgv2A2J008 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trgv2A2J008 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trgv2A2J008 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trgv2A2J008 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms