Protein–RNA interactions for Protein: A2BI93

Ssxb9, Synovial sarcoma, X member B9, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb9A2BI93 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ssxb9A2BI93 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssxb9A2BI93 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssxb9A2BI93 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssxb9A2BI93 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssxb9A2BI93 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssxb9A2BI93 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssxb9A2BI93 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssxb9A2BI93 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssxb9A2BI93 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb9A2BI93 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb9A2BI93 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb9A2BI93 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb9A2BI93 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb9A2BI93 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb9A2BI93 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssxb9A2BI93 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ssxb9A2BI93 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ssxb9A2BI93 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssxb9A2BI93 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssxb9A2BI93 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ssxb9A2BI93 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssxb9A2BI93 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssxb9A2BI93 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssxb9A2BI93 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssxb9A2BI93 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ssxb9A2BI93 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ssxb9A2BI93 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ssxb9A2BI93 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms