Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Rtf1A2AQ19 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Rtf1A2AQ19 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Rtf1A2AQ19 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rtf1A2AQ19 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rtf1A2AQ19 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rtf1A2AQ19 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rtf1A2AQ19 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rtf1A2AQ19 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rtf1A2AQ19 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rtf1A2AQ19 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rtf1A2AQ19 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rtf1A2AQ19 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rtf1A2AQ19 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rtf1A2AQ19 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Rtf1A2AQ19 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Rtf1A2AQ19 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rtf1A2AQ19 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Rtf1A2AQ19 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rtf1A2AQ19 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rtf1A2AQ19 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rtf1A2AQ19 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rtf1A2AQ19 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rtf1A2AQ19 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rtf1A2AQ19 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rtf1A2AQ19 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rtf1A2AQ19 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rtf1A2AQ19 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rtf1A2AQ19 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Rtf1A2AQ19 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rtf1A2AQ19 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rtf1A2AQ19 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rtf1A2AQ19 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rtf1A2AQ19 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rtf1A2AQ19 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rtf1A2AQ19 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rtf1A2AQ19 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rtf1A2AQ19 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rtf1A2AQ19 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rtf1A2AQ19 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rtf1A2AQ19 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rtf1A2AQ19 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rtf1A2AQ19 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rtf1A2AQ19 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rtf1A2AQ19 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Rtf1A2AQ19 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rtf1A2AQ19 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rtf1A2AQ19 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rtf1A2AQ19 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Rtf1A2AQ19 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rtf1A2AQ19 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rtf1A2AQ19 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rtf1A2AQ19 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Rtf1A2AQ19 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rtf1A2AQ19 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rtf1A2AQ19 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rtf1A2AQ19 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rtf1A2AQ19 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rtf1A2AQ19 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rtf1A2AQ19 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rtf1A2AQ19 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rtf1A2AQ19 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Rtf1A2AQ19 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rtf1A2AQ19 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rtf1A2AQ19 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Rtf1A2AQ19 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Rtf1A2AQ19 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rtf1A2AQ19 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rtf1A2AQ19 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rtf1A2AQ19 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rtf1A2AQ19 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rtf1A2AQ19 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rtf1A2AQ19 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rtf1A2AQ19 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rtf1A2AQ19 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rtf1A2AQ19 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Rtf1A2AQ19 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rtf1A2AQ19 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Rtf1A2AQ19 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Rtf1A2AQ19 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Rtf1A2AQ19 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Rtf1A2AQ19 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms