Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ankrd60A2AMD2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd60A2AMD2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ankrd60A2AMD2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd60A2AMD2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms