Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lcn6A2AJB9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lcn6A2AJB9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Lcn6A2AJB9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lcn6A2AJB9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lcn6A2AJB9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lcn6A2AJB9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lcn6A2AJB9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lcn6A2AJB9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lcn6A2AJB9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lcn6A2AJB9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms