Protein–RNA interactions for Protein: A2A7V7

Cd300c, CMRF35-like molecule 6, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300cA2A7V7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300cA2A7V7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300cA2A7V7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300cA2A7V7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd300cA2A7V7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300cA2A7V7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300cA2A7V7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd300cA2A7V7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd300cA2A7V7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300cA2A7V7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd300cA2A7V7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd300cA2A7V7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd300cA2A7V7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300cA2A7V7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300cA2A7V7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300cA2A7V7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cd300cA2A7V7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300cA2A7V7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300cA2A7V7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd300cA2A7V7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300cA2A7V7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd300cA2A7V7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300cA2A7V7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300cA2A7V7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300cA2A7V7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300cA2A7V7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300cA2A7V7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300cA2A7V7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300cA2A7V7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300cA2A7V7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms