Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Calcoco2A2A6M5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Calcoco2A2A6M5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Calcoco2A2A6M5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Calcoco2A2A6M5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Calcoco2A2A6M5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms