Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Pabpc1lA2A5N3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pabpc1lA2A5N3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pabpc1lA2A5N3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pabpc1lA2A5N3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pabpc1lA2A5N3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pabpc1lA2A5N3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pabpc1lA2A5N3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pabpc1lA2A5N3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pabpc1lA2A5N3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pabpc1lA2A5N3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pabpc1lA2A5N3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pabpc1lA2A5N3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pabpc1lA2A5N3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pabpc1lA2A5N3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pabpc1lA2A5N3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pabpc1lA2A5N3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pabpc1lA2A5N3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pabpc1lA2A5N3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pabpc1lA2A5N3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pabpc1lA2A5N3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pabpc1lA2A5N3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pabpc1lA2A5N3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Pabpc1lA2A5N3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Pabpc1lA2A5N3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pabpc1lA2A5N3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pabpc1lA2A5N3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pabpc1lA2A5N3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pabpc1lA2A5N3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pabpc1lA2A5N3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pabpc1lA2A5N3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pabpc1lA2A5N3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pabpc1lA2A5N3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pabpc1lA2A5N3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pabpc1lA2A5N3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Pabpc1lA2A5N3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pabpc1lA2A5N3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pabpc1lA2A5N3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pabpc1lA2A5N3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pabpc1lA2A5N3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pabpc1lA2A5N3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pabpc1lA2A5N3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pabpc1lA2A5N3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pabpc1lA2A5N3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pabpc1lA2A5N3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pabpc1lA2A5N3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pabpc1lA2A5N3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pabpc1lA2A5N3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pabpc1lA2A5N3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pabpc1lA2A5N3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pabpc1lA2A5N3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pabpc1lA2A5N3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pabpc1lA2A5N3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pabpc1lA2A5N3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pabpc1lA2A5N3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pabpc1lA2A5N3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Pabpc1lA2A5N3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pabpc1lA2A5N3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pabpc1lA2A5N3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pabpc1lA2A5N3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pabpc1lA2A5N3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pabpc1lA2A5N3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pabpc1lA2A5N3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pabpc1lA2A5N3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pabpc1lA2A5N3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms