Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Scn2aA0A0J9YTW6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Scn2aA0A0J9YTW6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scn2aA0A0J9YTW6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms