Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
USP18Q9UMW8 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms