Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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CSNK2A3Q8NEV1 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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CSNK2A3Q8NEV1 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM51DP-201ENST00000529746 596 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CSNK2A3Q8NEV1 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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