Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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