Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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SEC23BQ15437 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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SEC23BQ15437 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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SEC23BQ15437 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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SEC23BQ15437 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 AC092349.1-201ENST00000504903 310 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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SEC23BQ15437 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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SEC23BQ15437 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SEC23BQ15437 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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SEC23BQ15437 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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SEC23BQ15437 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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SEC23BQ15437 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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SEC23BQ15437 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SEC23BQ15437 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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