Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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SYCP1Q15431 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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SYCP1Q15431 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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SYCP1Q15431 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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SYCP1Q15431 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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SYCP1Q15431 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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SYCP1Q15431 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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