Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL4A6Q14031 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL4A6Q14031 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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COL4A6Q14031 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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COL4A6Q14031 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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