Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CACNA1SQ13698 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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