Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC073862.4-201ENST00000622982 854 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MTCO1P25-201ENST00000414449 1799 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MCFD2-202ENST00000409105 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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FOXE3Q13461 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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FOXE3Q13461 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL049840.5-201ENST00000602827 552 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC007012.2-201ENST00000623206 1676 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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