Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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TRAF1Q13077 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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TRAF1Q13077 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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TRAF1Q13077 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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TRAF1Q13077 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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TRAF1Q13077 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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TRAF1Q13077 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TRAF1Q13077 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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