Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PTPN13Q12923 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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