Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SCAPQ12770 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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