Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AHCYP8-201ENST00000425108 209 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RN7SL37P-201ENST00000490461 307 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC079600.3-201ENST00000547898 447 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 GNG2-203ENST00000553432 577 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 PLIN2-203ENST00000380465 631 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 ATP6V1G1P4-201ENST00000438388 335 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 GPX6-202ENST00000474923 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CHRNEQ04844 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms