Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC007349.3-201ENST00000415356 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC007359.1-202ENST00000419158 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC008175.1-201ENST00000446299 2939 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 VTCN1-203ENST00000369458 2612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CR1-204ENST00000367052 7469 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 CR1-205ENST00000367053 7469 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 OR10D1P-201ENST00000355343 936 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL139042.1-201ENST00000429137 305 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 LINC01771-201ENST00000445039 567 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MCCD1P59942 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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