Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 TFDP2-224ENST00000499676 9335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 TTC3P1-201ENST00000399586 6081 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 KIAA0100-203ENST00000544884 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CENPFP49454 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CENPFP49454 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CENPFP49454 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CENPFP49454 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
CENPFP49454 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AC016705.2-202ENST00000559008 6878 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CENPFP49454 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms