Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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PTPRCP08575 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
PTPRCP08575 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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PTPRCP08575 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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PTPRCP08575 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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PTPRCP08575 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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PTPRCP08575 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PTPRCP08575 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
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