Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms