Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP35Q9P2H5 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms