Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AC012511.1-201ENST00000608140 449 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ANKRD42Q8N9B4 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AL132671.1-201ENST00000415736 308 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ANKRD42Q8N9B4 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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