Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CDKN3Q16667 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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