Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FXNQ16595 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FXNQ16595 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
FXNQ16595 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC107952.1-201ENST00000524200 376 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
FXNQ16595 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.1 ms