Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
VPS72Q15906 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
VPS72Q15906 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms