Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OR2L9P-201ENST00000444456 913 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL022068.1-208ENST00000447250 1016 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SMR3B-202ENST00000504825 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MIR9-3HG-211ENST00000561037 779 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 STARD6-204ENST00000584040 660 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MIR6834-201ENST00000622807 81 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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