Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PSD4-205ENST00000441564 11234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ACACB-202ENST00000377848 9247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 DRP2-205ENST00000541709 6835 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SHPRH-203ENST00000367505 7201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 TTL-201ENST00000233336 14269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LHX9-203ENST00000367390 7413 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MYO10-201ENST00000274203 11456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 HHIP-201ENST00000296575 10072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 EPHB2-204ENST00000400191 10816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ABCA4-201ENST00000370225 7309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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