Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SHBQ15464 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SHBQ15464 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
SHBQ15464 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SHBQ15464 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms