Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CHD4Q14839 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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