Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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