Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
CHAF1AQ13111 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
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